1899年夏，中院校舍落成，为砖墙木窗三层长方形建筑，占地2313平方米，有83间房，造费为规元49926两2钱。一楼设有中院主任室、教员休息室、化学实验室、化学讲堂、膳厅等。二楼是教室，约可容纳30个学生。三楼为宿舍，需要时很容易改成教室。8月，全校迁入中院，校外宿舍退租。

中院经过1963、1999年的两度大修，迄今还保存完好。